作为中国农业生物技术产业化领域的一名开拓者，方宣钧博士在产业化领域的职业生涯始于1987-1990年在农业部工作期间。三年的政府部门工作经历，使得方宣钧博士对中国农业研发与产业的现状及发展有深刻的认识。

    1988年作为农业部的代表在北京中关村建立了《北京钟秀农业生物技术有限公司》，并担任总经理，从事农业生物技术的产业化尝试。尽管该公司因1989年国家的相关政策的调控而撤销，但这是方宣钧博士迈向农业生物技术产业化领域的第一步。

    1990年方宣钧买下北京军区一群老干部创办的《北京海淀秋实经济技术开发部》并将其变更为《北京市海淀区华德技术公司》，在誉为中国硅谷的中关村进行计算机的组装、销售、服务以及碳分子筛制氮机的开发、生产和技术服务，挖得了人生的第一桶金。

    1997年在中国农科院生物技术中心、科技部中国农业生物技术发展中心以及中国抗虫棉专利拥有人的支持下，以商业化手段推动国家级项目“转基因抗虫棉”产业化。1998年方宣钧博士带领他的团队在深圳创办了“创世纪转基因技术有限公司”，担任执行董事和总经理。在管理和运行创世纪转基因技术有限公司的三年间，成功狙击了国外抗虫棉的在大规模扩张，取得了以知识产权为核心，开展转基因抗虫棉商业化的实践经验。1998年方宣钧博士的被中央电视台誉为中国先导产业的“未来之星”，提出了“一个基因就是一个产业”的理念，其事迹拍摄成电视记录片在中央电视台播放。

    1999年10月海南省人民政府科技厅任命方宣钧博士为海南省热带农业资源开发利用研究所所长。在海南省三亚市崖城镇马丹村艰苦的环境条件，凭着一股执着和献身精神，利用先进的科学技术、科学的管理理念，使海南省热带农业资源所成为研究条件一流，研究水平国内领先，在国际上有广泛影响的热带农业资源研究与产业化中心。

    2000年方宣钧博士发起成立了民营的非营利组织，海南省生物工程协会，通过海南省生物工程协会，推动海南生物工程研究与发展以及产业化的发展。

    2000年海南日报整版报道了方宣钧博士的创业事迹。为此，2001年12月中国科技部、人事部联合授予方宣钧博士《全国科技管理系统先进工作者》称号（省部级劳动模范）。同年12月共青团中央、全国青联授予方宣钧博士第五届《中国优秀青年科技创新奖》称号。

    2002年7月成功将海南省热带农业资源开发利用研究所转制为独立的民营研究所，开创了我国国有事业单位研究所转制成民营研究所的先例。由此获得首届（2004）海南省新闻人物提名奖，被香港文汇报誉为“知本科学家”。

    2005年方宣钧成功的将提高杂交水稻产量的分子育种技术许可给拜耳作物科学公司使用，首次将“知识和技术诀窍”变成了财富，实现知识产权的回报。

    2007年方宣钧博士与德国拜耳作物科学公司合作，建立“三亚海耳水稻研究中心”，建立了“海德转基因GMO试验设施”，成为一个符合欧洲标准的GMO试验及环境释放基地。

    2010年方宣钧博士与美国SynTech Research 合作在加州Fresno建立了Bt生物测定联合实验室，成功地将拥有自主产权的Bt基因许可给美国公司。并与美方合作创立BtGen Bio LLC公司，开展Bt生物农药以及Bt作物的研究与应用。

     2012年方宣钧博士邀请全球著名的CRO公司美国SynTech Research公司在三亚设立中国总部，推动中国农业生物技术研究与应用第三方服务。

    2013年9月17-19，在加拿大阿尔伯塔省卡尔加里市召开的第13届农业生物技术国际大会，（The Agricultural Biotechnology International Conference，ABIC 2013），将本次大会的唯一奖项颁发给海德研究所方宣钧博士的科研项目Discovering Novel B.t. Toxins for Better Bio-pesticides and Biotech Crops。本次大会来自全球23个国家的424代表出席了本届盛会，共同探讨农业生物技术在农业，能源，预防保健（人和动物）和投资四个领域中的作用。大会评审委员会对来自卫生和农业（粮食），环境/全球管理，和生产力/质量三大类的所有优秀研究项目中进行严格的选择，评选出大会唯一获胜者。